（一）效率高。
1、傳統(tǒng)紙本手冊，受制于8小時工作制；聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管后，錄入、發(fā)送、網(wǎng)絡(luò)傳輸都是24小時的工作制。
2、傳統(tǒng)紙本手冊是對每個合同進行審批，包括準(zhǔn)備合同資料、打印、兩次錄入、網(wǎng)絡(luò)傳輸、審批等過程，共約需7－8天，甚至10多天。聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管省卻了前期大量的準(zhǔn)備合同資料、錄入時間、電子資料的發(fā)送接收時間，到外經(jīng)貿(mào)部門申請聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管批準(zhǔn)證和到海關(guān)進行電子賬冊備案都是通過計算機網(wǎng)絡(luò)進行，審批大約需要兩天時間。
3、按傳統(tǒng)合同手冊，一般情況下每個企業(yè)都有幾十本，甚至上百本手冊，報關(guān)單的數(shù)量也相當(dāng)驚人，導(dǎo)致的手冊之間的結(jié)轉(zhuǎn)、核銷的工作量非常大；按聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管，企業(yè)只需一個業(yè)務(wù)批準(zhǔn)證，一本電子賬冊，實行滾動核銷，報關(guān)單的數(shù)量將會明顯下降，核銷期間照常通關(guān)，企業(yè)進出口通關(guān)效率會得到大幅提高。
4、企業(yè)申請批準(zhǔn)證，除第一次申請需要提交法律規(guī)定的材料以外，以后申請批準(zhǔn)證、變更、核銷等直接從網(wǎng)上進行申請，外經(jīng)貿(mào)部門審批后，企業(yè)不需要帶任何資料，直接到審批部門領(lǐng)取批準(zhǔn)證，很大程度上方便了企業(yè)。
（二）靈活性強。
1、單耗分段備案，最遲可在成品出口前備案，根據(jù)成品版本號申報準(zhǔn)確實際的單損耗情況，申報數(shù)據(jù)更加準(zhǔn)確。
2、通關(guān)時無須調(diào)度手冊，只用一本電子賬冊，不會串料，自動核對核算，提高核銷的效率及精度，通過最大批準(zhǔn)量、最大周轉(zhuǎn)金額進行控制，中期核查使企業(yè)既能及時糾正或預(yù)先堵塞企業(yè)內(nèi)部物流管理漏洞。
3、進口料件和出口成品的海關(guān)編碼都實行4位管理，實行大類歸并，商品小類變更由企業(yè)自行做主，不必報審批機關(guān)批準(zhǔn)，使企業(yè)在同一時間內(nèi)可以接收更多的訂單，提高企業(yè)接單的靈活性和自主性。
（三）費用省。
1、企業(yè)生產(chǎn)成本下降。聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管實行分段備案、只控制料件的最大周轉(zhuǎn)量和周轉(zhuǎn)金額，不受具體合同料件數(shù)量和金額的限制，更適應(yīng)企業(yè)現(xiàn)代生產(chǎn)經(jīng)營和物流要求，使企業(yè)得以按生產(chǎn)管理的實際需要安排物流和組織進出口，大大減少企業(yè)庫存，生產(chǎn)成本大幅度降低。據(jù)聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管企業(yè)奧林巴斯反映，聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管后，企業(yè)每個月僅在庫金額一項就下降了340萬港幣。
2、企業(yè)交納的費用減少。按傳統(tǒng)合同手冊，加工貿(mào)易企業(yè)要按料件清單份數(shù)交納錄入費；聯(lián)網(wǎng)監(jiān)管后，企業(yè)只需交納網(wǎng)絡(luò)維護費，能節(jié)省大量經(jīng)營費用。