2008年3月21日《國務(wù)院關(guān)于機構(gòu)設(shè)置的通知》規(guī)定部門設(shè)置如下:

國務(wù)院設(shè)置辦公廳、國務(wù)院組成部門（27個）、國務(wù)院直屬特設(shè)機構(gòu)（1個）、國務(wù)院直屬機構(gòu)（16個）、國務(wù)院辦事機構(gòu)（4個）、國務(wù)院直屬事業(yè)單位（17個）、國務(wù)院部委管理的國家局（22個）、國務(wù)院議事協(xié)調(diào)機構(gòu)（33個）。

2013年3月10日,國務(wù)院機構(gòu)改革和職能轉(zhuǎn)變方案公布。這次改革，國務(wù)院正部級機構(gòu)減少4個，其中組成部門減少2個，副部級機構(gòu)增減相抵數(shù)量不變。改革后，除國務(wù)院辦公廳外，國務(wù)院設(shè)置組成部門由2008年的27個變?yōu)?5個。

2018年3月13日，國務(wù)院機構(gòu)改革方案公布，根據(jù)該方案，改革后，國務(wù)院正部級機構(gòu)減少8個，副部級機構(gòu)減少7個，除國務(wù)院辦公廳外，國務(wù)院設(shè)置組成部門26個。

中華人民共和國國務(wù)院辦公廳

中華人民共和國外交部

中華人民共和國國家發(fā)展和改革委員會

中華人民共和國科學(xué)技術(shù)部

中華人民共和國國家民族事務(wù)委員會

中華人民共和國國家安全部

中華人民共和國司法部

中華人民共和國人力資源和社會保障部

中華人民共和國生態(tài)環(huán)境部

中華人民共和國交通運輸部

中華人民共和國農(nóng)業(yè)農(nóng)村部

中華人民共和國文化和旅游部

中華人民共和國退役軍人事務(wù)部

中國人民銀行

中華人民共和國國防部

中華人民共和國教育部

中華人民共和國工業(yè)和信息化部

中華人民共和國公安部

中華人民共和國民政部

中華人民共和國財政部

中華人民共和國自然資源部

中華人民共和國住房和城鄉(xiāng)建設(shè)部

中華人民共和國水利部

中華人民共和國商務(wù)部

中華人民共和國國家衛(wèi)生健康委員會

中華人民共和國應(yīng)急管理部

中華人民共和國審計署

教育部對外保留國家語言文字工作委員會牌子。科學(xué)技術(shù)部對外保留國家外國專家局牌子。工業(yè)和信息化部對外保留國家航天局、國家原子能機構(gòu)牌子。自然資源部對外保留國家海洋局牌子。生態(tài)環(huán)境部對外保留國家核安全局牌子。

國務(wù)院國有資產(chǎn)監(jiān)督管理委員會

中華人民共和國海關(guān)總署

國家市場監(jiān)督管理總局

國家體育總局

國家國際發(fā)展合作署

國務(wù)院參事室

國家稅務(wù)總局

國家廣播電視總局

國家統(tǒng)計局

國家醫(yī)療保障局

國家機關(guān)事務(wù)管理局

國家市場監(jiān)督管理總局對外保留國家認證認可監(jiān)督管理委員會、國家標準化管理委員會牌子。國家新聞出版署（國家版權(quán)局）在中央宣傳部加掛牌子，由中央宣傳部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國家宗教事務(wù)局在中央統(tǒng)戰(zhàn)部加掛牌子，由中央統(tǒng)戰(zhàn)部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。

國務(wù)院港澳事務(wù)辦公室

國務(wù)院研究室

國務(wù)院僑務(wù)辦公室在中央統(tǒng)戰(zhàn)部加掛牌子，由中央統(tǒng)戰(zhàn)部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國務(wù)院臺灣事務(wù)辦公室與中共中央臺灣工作辦公室、國家互聯(lián)網(wǎng)信息辦公室與中央網(wǎng)絡(luò)安全和信息化委員會辦公室，一個機構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機構(gòu)序列。國務(wù)院新聞辦公室在中央宣傳部加掛牌子。

新華通訊社

中國社會科學(xué)院

國務(wù)院發(fā)展研究中心

中國氣象局

中國證券監(jiān)督管理委員會

中國科學(xué)院

中國工程院

中央廣播電視總臺

中國銀行保險監(jiān)督管理委員會

國家行政學(xué)院與中央黨校，一個機構(gòu)兩塊牌子，作為黨中央直屬事業(yè)單位。

國家信訪局（由國務(wù)院辦公廳管理）

國家能源局（由國家發(fā)展和改革委員會管理）

國家煙草專賣局（由工業(yè)和信息化部管理）

國家林業(yè)和草原局（由自然資源部管理）

中國民用航空局（由交通運輸部管理）

國家文物局（由文化和旅游部管理）

國家煤礦安全監(jiān)察局（由應(yīng)急管理部管理）

國家藥品監(jiān)督管理局（由國家市場監(jiān)督管理總局管理）

國家糧食和物資儲備局（由國家發(fā)展和改革委員會管理）

國家國防科技工業(yè)局（由工業(yè)和信息化部管理）

國家移民管理局（由公安部管理）

國家鐵路局（由交通運輸部管理）

國家郵政局（由交通運輸部管理）

國家中醫(yī)藥管理局（由國家衛(wèi)生健康委員會管理）

國家外匯管理局（由中國人民銀行管理）

國家知識產(chǎn)權(quán)局（由國家市場監(jiān)督管理總局管理）

國家移民管理局加掛中華人民共和國出入境管理局牌子。國家林業(yè)和草原局加掛國家公園管理局牌子。國家公務(wù)員局在中央組織部加掛牌子，由中央組織部承擔(dān)相關(guān)職責(zé)。國家檔案局與中央檔案館、國家保密局與中央保密委員會辦公室、國家密碼管理局與中央密碼工作領(lǐng)導(dǎo)小組辦公室，一個機構(gòu)兩塊牌子，列入中共中央直屬機關(guān)的下屬機構(gòu)序列。

（國務(wù)院機構(gòu)和部委管理的國家局設(shè)置信息，據(jù)國發(fā)〔2018〕6號和國發(fā)〔2018〕7號文件）^[5]